Yavia cryptocarpa è un cactus di piccole dimensioni. Presenta un fusto a forma di ventaglio leggermente contorto; una radice tuberosa e piccole spine poco visibili. Le areole, in coltivazione sono pelose e biancastre. La pianta nei periodi di siccità tende a restringersi fino ad arrivare al livello del suolo in modo tale da poter conservare l’umidità; al contrario in coltivazione con un’adeguata umidità mostra una forma più allungata. La sua forma crestata attribuisce alla pianta un grande valore in quando risulta essere molto rara e ricercata dai collezionisti. I fiori di Yavia nascono come piccoli boccioli sulle tonalità del giallo, in tarda primavera, per poi trasformarsi in fiori rosa.